Die Altonaer Gesundheits- und Pflegekonferenz hat sich eine verbindliche Organisationsform gegeben. Das alle zwei Jahre stattfindende Plenum befasst sich mit aktuellen Themen aus dem Altonaer Gesundheits- und Pflegebereich. Es nimmt die Berichte der Arbeitsgruppen entgegen und befindet über weitere Aktivitäten. Die Koordinationsgruppe vermittelt Interessen aus dem Plenum und den Arbeitsgruppen. Das Herzstück der Gesundheits- und Pflegekonferenz sind die Arbeitsgruppen. Jede Gruppe lebt von den Beiträgen und der Aktion ihrer Mitglieder, die im jeweiligen Handlungsfeld aktiv sind. Zurzeit arbeiten vier Arbeitsgruppen.