Die Leitung eines Bezirksamtes in Hamburg wird durch die Bezirksamtsleiterin oder den Bezirksamtsleiter ausgeübt. Alle sieben Bezirksämter sind in vier Dezernate mit unterschiedlichen Aufgabenbereichen unterteilt, so auch das Bezirksamt Harburg. Jedes Dezernat wird durch einen Dezernenten oder Dezernentin geleitet.
Bezirksamtsleiterin Sophie Fredenhagen bildet zusammen mit den Dezernenten Dierk Trispel und Thorsten Schulz, Dezernentin Dr. Anke Jobmann sowie Dezernent Hans Christian Lied das Leitungsteam des Bezirksamtes Harburg.