Das Amt stellt den ordnungsgemäßen medienübergreifenden anlagen- und betriebsbezogenen Umweltschutz durch Zulassungen wie immissionsschutz-, abwasser- und deponierechtliche Genehmigungen und wasserrechtliche Erlaubnisse sowie deren Überwachung und Beratung der Betriebe sicher. Standards im Umweltschutz werden hierbei kontinuierlich weiterentwickelt.
Weitere Aufgabenschwerpunkte des Amtes sind der Schutz vor schädlichen Auswirkungen gentechnischer Verfahren und Produkte, die Lärmaktionsplanung für den Ballungsraum Hamburg, der Fluglärmschutz mit der Kontrolle der nächtlichen Flugbewegungen sowie die Luftreinhalteplanung und die Abfallwirtschaftsplanung.
Über die fachliche Steuerung der Stadtreinigung Hamburg insbesondere zu den Themen kommunale Abfallentsorgung, Wegereinigung und Winterdienst wird die Sauberkeit der Stadt Hamburg optimiert. Die Schiffsentsorgung von Abfällen wird über Hafenauffangeinrichtungen nach dem internationalen MARPOL-Abkommen sichergestellt.
Ziel des Amtes ist es, bei ihren Aufgaben insgesamt ein hohes Umweltschutzniveau unter Beachtung der vorhandenen Rechtsgrundlagen zu erreichen.