Sequenzierplattformen
- Short read sequencing: Illumina
- Long read sequencing: Oxford Nanopore Technologies
Probenvorbereitung und Sequenzierung - Wetlab
- Quantitative und qualitative Überprüfung von DNA- und RNA-Proben sowie NGS-Bibliotheken
- Anfertigung von DNA- und RNA-Bibliotheken
- DNA- und RNA-Sequenzierungen mittels NGS
Bioinformatik und rechnergestützte Analysen - Drylab
- Nachverfolgung von Infektionsketten bakterieller oder viraler Erreger
Virusvariantendetektion (variant call, SNP) und Bakterien-Gesamtgenomsequenzierung (de novo, reference based assembly, cgMLST, SNP) - Diversitätsanalysen von Mischproben (Metagenomics)
Authentizität von Lebensmittelproben (Tierartendetektion, etc.) und Charakterisierung hochdiverser Umweltproben (Diversität, Data mining)
Beratung
Service-Leistungen des NGS-Labors stehen auch externen Auftraggebern zur Verfügung. Anfragen zu NGS und Omics bitte senden an ngs@hu.hamburg.de.
