Bereits 1892 wurde das Institut in Hamburg gegründet. Seit 1. Juli 2020 ist es Teil der Behörde für Umwelt, Klima, Energie und Agrarwirtschaft und fungiert als Landeslabor der Freien und Hansestadt Hamburg. Seit Anfang 2015 wird das Institut als Landesbetrieb nach § 106 Absatz 1 der Landeshaushaltsordnung geführt.
Das Institut für Hygiene und Umwelt besteht organisatorisch aus drei analytisch orientierten Fachbereichen sowie der Abteilung Service und Steuerung und verschiedenen Stabsstellen. Seine Aufgaben sind vor allem die amtliche Untersuchung und Begutachtung von Lebens- und Futtermitteln, Städte- und Krankenhaushygiene, human- und veterinärmedizinische Diagnostik sowie Umweltanalytik und Umweltüberwachung.
Die rund 300 Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter aus Naturwissenschaft, Medizin, Technik, Labor, Verwaltung und anderen Fachdisziplinen setzen sich täglich dafür ein, den Zustand der Umwelt zu beobachten, Gefahren für Mensch, Tier und Natur abzuwehren, die Verbraucherinnen und Verbraucher vor mangelhaften Produkten zu schützen und die Gesundheit der Bevölkerung zu bewahren. In unseren Laboren bilden wir auch Chemielaboranten aus. Zudem sind wir zuständig für die praktische Ausbildung und die zweite Staatsprüfung von Lebensmittelchemikern.